Hallo, vllt könnte mir jemand von euch helfen bei folgender Prüfungsfrage:

Das unten dargestellte Plasmid wird verschiedenen Restriktionsverdauen unterzogen, bei denen jeweils 2 Restriktionsenzyme gemeinsam eingesetzt werden (Doppelverdau). Zur leichteren Orientierung sind die Restriktionsstellen hervorgehoben. Welcher der Doppelverdaue entspricht dem dargestellten Bild der nachfolgenden Agarosegelelektrophorese:
a. EcoRI und Aval
b. EcoRI und Nrul
c. Xbal und Apal
d. EcoRI und PstI

Normalerweise ist, wie eh in der Frage beschrieben, noch ein Bild dabei. Hatte die Frage bei meinem letzten Antritt und habe leider keine Ahnung wie man auf die richtige Antwort kommt...ich bin dankbar für jede Hilfe!

Anhand eines Agarosegels kannst du vermutlich die zwei Banden erkennen und die Länge dieser bestimmen. Dazu hat man normalerweise einen Marker in einen der äußeren Spuren.
Wenn du nun die ungefähre Größe der Banden kennst, dann musst du nur mehr schauen welche Schnittpunkte nötig wären um diese Banden zu bekommen (sprich welche Restriktionsenzyme du in den Ansatz pipettieren musst).

merci!!

Hab eine Frage bei der ich grad bissl anstehe:

1.was ist KEIN palindrom:

a) 5' CCTAGG 3'
b) 5' GCGGCCGC 3'
c) 5' AATTAA 3'
d) 5' GAATTC 3'

bin ich da grad ganz gaga oder erkenne ich es nur nicht? normalerweise müsste man ja alles von 3-5' genau so gleich lesen können. welcher davon stimmt hier jetzt aber nicht?

2.Das Tryptophan Biosynthese Operon
Wählen Sie eine Antwort:
a. wird direkt durch Assoziation mit Tryptophan reprimiert
b. wird durch durch Bindung des Tryptophan-Repressors im Operatorbereich aktiviert
c. wird durch durch Bindung eines Tryptophan -- Tryptophan-Repressor Komplexes im Operatorbereich reprimiert
d. wird durch den Tryptophan Repressor in Abwesenheit von Tryptophan reprimiert

Das Operon wird ja nur dann aktiviert wenn es selbst Tryphtophan herstellen muss, weil sich keins in der Umgebung der Zelle befindet. Welche Antwort wäre daher auf gut deutsch richtig?

3. Substrat für die RNA-Polymerase sind
a. ATP, CTP, UTP, GTP
b. dATP, dCTP, dUTP, dGTP
c. dATP, dCTP, dTTP, dGTP
d. ATP, CTP, TTP, GTP

4. Proteinogene Aminosäuren werden anhand ihrer Eigenschaften grob in folgende Gruppen klassifiziert
a. neutral, kationisch und anionisch
b. linear, asymmetrisch und symmetrisch
c. sauer, basisch, polar, unpolar/hydrophob
d. groß und klein

für 3 und 4 hab ich die antworten gefunden aber 1 und 2 fehlt mir noch immer.

zu Frage 1:

nehme mal an dass die Antwort in dem fall b ist.
bei Antwort a z.b. hast du in 5' 3' Richtung gelesen die Basentripletts CCT und AGG. umgekehrt GGA und TCC also das ändert nichts -> palindromisch.

bei b ist es dann so:
5' 3' : GCG GCC GC
umgekehrt CGC CGG CG

hoffe ich hab das so richtig verstanden, vllt kann sich ja noch wer melden der das bestätigen kann.

Eine palindromischen Sequenz ist eine Sequenz die 5'->3' am Primärstrang gelesen das gleiche ergibt wie 5'->3' am Komplementärstrang.

Wenn man den Doppelstrang aufschreibt:
a)
5' CCTAGG 3'
3' GGATCC 5'

b)
5' GCGGCCGC 3'
3' CGCCGGCG 5'

c)
5' AATTAA 3'
3' TTAATT 5'

d)
5' GAATTC 3'
3' CTTAAG 5'

Sieht man sofort dass c) zwar symmetrisch aber kein Palindrom ist.

Bestätigung durch http://www.alagu-molbio.net/palin.html

Re Tryptophansynthese, siehe z.B. hier:
http://www.ndsu.edu/pubweb/~mcclean/pls ... karyo3.htm

stimmt, einfach gesagt es muss quasi ein Spiegelbild ergeben. ok jetzt check ich's!
Danke dafür!



ja diese Seite kenn ich auch, habe es mir auch durchgelesen. diesen abschnitt:

"The trp operon is a repressible system. The primary difference between repressible and inducible systems is the result that occurs when the effector molecule binds to the repressor. With inducible systems, the binding of the effector molecule to the repressor greatly reduces the affinity of the repressor for the operator, the repressor is released and transcription proceeds. The lac operon is an example of an inducible system.
With repressible systems, the binding of the effector molecule to the repressor greatly increases the affinity of repressor for the operator and the repressor binds and stops transcription. Thus, for the trp operon , the addition of tryptophan (the effector molecule) to the E. coli environment shuts off the system because the repressors binds at the operator."

ich verstehe wie das funktioniert aber die Sätze in den antworten machen mich verrückt weil sie unverständlich für mich sind.
da würde ich Antwort a) nehmen, weil es am ehesten sinn und vor allem, dem letzten Satz entspricht.
oder?

Der Schlüsselsatz in der Webseite ist folgender:

With repressible systems, the binding of the effector molecule to the repressor greatly increases the affinity of repressor for the operator and the repressor binds and stops transcription.

Gehen wir es Schritt für Schritt durch:

2.Das Tryptophan Biosynthese Operon
Wählen Sie eine Antwort:
a. wird direkt durch Assoziation mit Tryptophan reprimiert

Falsch, da Trp nicht an die DNA bindet.

b. wird durch durch Bindung des Tryptophan-Repressors im Operatorbereich aktiviert

Der Trp Repressor reprimiert die Transkription wenn er an die DNA gebunden ist -> Antwort falsch.

c. wird durch durch Bindung eines Tryptophan -- Tryptophan-Repressor Komplexes im Operatorbereich reprimiert

Der Repressor bindet nur an die DNA wenn er mit Trp komplexiert ist. Da der Repressor dann reprimiert ist die Antwort richtig.

Wenn kein Trp mehr da ist zerfällt der Trp-Repressorkomplex, der Repressor dissoziert von der DNA, die mRNA Synthese kommt in Gang ->> Synthese von Tryptophan.

d. wird durch den Tryptophan Repressor in Abwesenheit von Tryptophan reprimiert

Das beschreibt induzierbares System (Abwesenheit = Repression, Anwesenheit = Aktivierung) -> Falsch

mit deinen Worten machen die antworten mehr sinn, bzw so kann ich die antworten eher verstehen. oh man, wieso nicht einfach wenns auch kompliziert geht...
tausend dank für die detaillierte Beantwortung!!

Kein Problem.

Die Antworten sind an und für sich sehr klar. Man muss nur strikt logisch und vor allem Schritt für Schritt vorgehen, sich überlegen welches Szenario die Frage beschreibt und dann das mit dem Szenario vergleichen das vorliegt. Passt es -> richtig, passt es nicht (auch bei kleinen Details) -> falsch.