Characterization of rope forming Bacillus isolates

Bread is one of the most important staple foods worldwide. Rope spoilage in bread is a long-known phenomenon of caused by aerobic endospore-forming bacteria, such as Bacillus spp. Research efforts in the matter have been limited and many aspects associated with the development of this spoilage phenomenon remain unclear. The purpose of this master thesis is to identify a set of bacterial strains originating from the bakery environment and belonging to the Bacillus genus. This is done by the use different techniques, like matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and molecular methods like 16s rDNA and gyrA/gyrB gene sequencing. Further, the strains will be characterized by the use of different growth media and molecular methods like RAPD-PCR and Rep-PCR.

Charakterisierung von fadenziehenden Bazillen

Brot ist eines der weltweit wichtigsten Lebensmittel. Ein altbekanntes Verderbsphänomen des Brotes ist das sogenannte Fadenziehen, welches durch aerobe sporenbildende Bakterien der Gattung Bacillus hervorgerufen wird. Viele Aspekte im Zusammenhang mit der Entwicklung des Fadenziehens sind bis heute unklar. Daher soll im Zuge dieser praktischen Arbeit ein bestimmtes Stammset an Isolaten aus der Bäckereiumgebung mittels verschiedener Methoden wie Matrix-Assistierter Laser-Desorption-Ionisierung TOF Massenspektrometrie (MALDI-TOF MS), Sequenzierung der 16S rDNA und des gyrA/gyrB Gens identifiziert werden. Zudem sollen die Isolate mikrobiologisch mittels verschiedener Nährmedien, sowie durch molekularbiologische Methoden wie RAPD-PCR und Rep-PCR charakterisiert werden.

Skills:
• High Motivation and Teamwork
• Basic Lab Skills (MiBi/MoBi) und sauberes Arbeiten

Contact:
Nicola Pacher
nicola.pacher@boku.ac.at

Details:
Start/Duration: May 2022/ practical work 5 to 6 months
Location: BOKU- Institute of Food Science
Language: German or English